Могущественный владелец оружейной корпорации Джеймс Маккаллен (Кристофер Экклстон) создает новое оружие массового поражения, которое было разработано по заказу НАТО. Однако вскоре выясняется...
, что у него свои планы на это сверхоружие. Маккаллен еще не знает, что для защиты наномитных боеголовок был создан специальный отряд агентов под названием G.I. Joe, который базируется в Египте. Его членам придется выйти на тропу кровавой войны с Маккалленом и его союзниками.